2005年に神戸大学のルミアナ・ツェンコヴァ教授によって導入されて以来、アクアフォトミクスに関する研究は世界中の多くの大学や研究所で行われています。以下はアクアフォトミクス手法を研究に取り入れている研究グループの一部です。
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（※グループの所在国のアルファベット順に並んでいます）
オーストリア (Austria)
グループリーダー：クリスティアン・ハック教授
所属：インスブルック大学（レオポルト＝フランツェンス大学） 化学・バイオ医科学センター（CCB） 分析化学・放射化学研究所
研究テーマ：近赤外および分子分光法、バイオアナリシス、植物製剤、材料科学
オーストリア、ハンガリー (Austria, Hungary)
研究テーマ：近赤外分光法および関連機器、データ評価技術、ソフトウェアとプログラミング
ブルガリア(Bulgaria)
グループリーダー：アルベルト・クラスタノフ教授（理学博士, DSc）
所属：プロヴディフ食品技術大学（University of Food Technologies, Plovdiv, Bulgaria）
研究テーマ：バイオテクノロジー、食品技術、プロバイオティクス、細菌選抜、酵素技術
中国 (China)
グループリーダー：シャオ・シュエグアン（邵 学广）教授
所属：南開大学 化学学院
研究テーマ：ケモメトリクス、近赤外分光法、分析化学
中国（China）
グループリーダー：ザン・ヘンチャン（臧 恒昌 ）教授
所属：山東大学 薬学部（School of Pharmaceutical Sciences, Shandong University, China）
研究テーマ：プロセス分析技術、近赤外分光法、アクアフォトミクス
ドイツ（Germany）
グループリーダー：マヌエラ・ツーデ教授
所属：ライプニッツ農業工学・バイオエコノミー研究所（ATB, Leibniz Institute for Agricultural Engineering and Bioeconomy）
研究テーマ：果実品質、灌漑、酸素不足、空間分解分光法、周波数分光法
イタリア（Italy）
グループリーダー：ティツィアーナ・M.P.・カッタネオ
所属：農業研究・農業経済分析評議会（CREA, Consiglio per la ricerca in agricoltura e l’analisi dell’economia agraria）
研究テーマ：農産食品、加工製品、収穫後研究、分光法
日本（Japan）
グループリーダー：ルミアナ・ツェンコヴァ教授
所属：神戸大学
研究テーマ：近赤外分光法、水科学、バイオ計測学、アクアフォトミクス
マレーシア（Malaysia）
グループリーダー：アーマド・フェイルズ・オマール博士
所属：マレーシア科学大学 物理学部（School of Physics, Universiti Sains Malaysia）
研究テーマ：環境、食品品質、植物病害、がん検出、皮膚科学
オランダ（Netherlands）
グループリーダー：エヴェリーネ・ファン・デ・クラーツ博士
所属：独立研究者（オランダ）
研究テーマ：水の機能性、アクアフォトミクス、近赤外分光法（NIR）、超微弱光子放出（UPE）、農業、人の健康
セルビア（Serbia）
グループリーダー（前任）：イェレナ・ムンカン助教授
所属：ベオグラード大学 生体医工学科
研究テーマ：バイオマテリアルの特性評価、バイオメディカル診断と治療、アクアフォトミクス
スペイン（Spain）
グループ名：Symbiogene
グループリーダー：ペドロ・カラスコ / ミリアム・カタラ
所属：レイ・フアン・カルロス大学（Universidad Rey Juan Carlos, Spain）
研究テーマ：非生物的ストレス、無代謝乾燥（アンヒドロビオシス）、微細藻類、地衣類、乾燥耐性
スリランカ（Sri Lanka）
グループリーダー：カナジ・マサコララ教授（博士）
所属：ルフナ大学 理学部 植物学科
研究テーマ：イネにおける鉄毒性によるストレスの特性評価
スリランカ（Sri Lanka）
グループリーダー：ラシャ・マネージ博士
所属：ケラニヤ大学 理学部 動物学・環境管理学科
研究テーマ：多様な環境要因における水質モニタリング、有害廃棄物の特性評価、環境汚染、環境毒性学、土壌特性と機能性の理解
アメリカ合衆国（United States）
グループリーダー：キャリー・K・ヴァンス
所属：ミシシッピ州立大学 生化学・分子生物学・昆虫学・植物病理学部門
研究テーマ：動物生理学、両生類保全、近赤外分光法（NIR）および核磁気共鳴分光法（NMR）の動植物病原体・疾患への応用