AquaGrammar Help

はじめに

4 つのステップで、最初の Aquagram® を作成します。設定する項目はありません。サンプルデータが 2 件同梱されているため、ファイルを用意する必要もありません。

始める前に

4 つのステップは常に画面左側に表示され、現在の段階が強調されます。いつでも前のステップに戻れます。作業内容は失われません。

3 つのカードが表示されます。

自分のファイルを開く — 破線のカードに MicroNIR ファイルをドラッグするか、 ファイルを選択を押します。対応形式は .sam、ベンダー CSV、ベンダー XLSX です。
Demo 1 — Natural Systems — Demo 1 を開くを押すと、岩石・鉱物スキャンの 9 群が読み込まれます。
Demo 2 — Water — Demo 2 を開くを押すと、水源スキャンの 4 群が読み込まれます。

操作を学ぶ目的であれば、Demo 1 から始めてください。ファイルを読み込むと、 AquaGrammar は自動的にステップ 2 へ進みます。

ファイルはサンプル群に分割されます。各群には名前と繰り返し測定の回数が表示されます。 Stone1 (n=15) は Stone1 を 15 回測定したという意味です。

使用する群にチェックを入れます。 初期状態では何も選択されていません。チェックしていない群は完全に除外され、以降の処理には一切影響しません。 すべて選択と選択を解除は右下にあります。
カウンターを確認します。（例：「9 件中 3 件選択」）現在の選択状態が常に表示されます。
SNV の範囲を選びます。 リストの下に 3 つの選択肢があります。

第1倍音 1300–1600 — 推奨される選択です。Classic-12 の 12 座標が実際に含まれる領域であり、プロットする範囲を基準に各スペクトルが正規化されます。
全範囲 — ファイル内のすべての波長で正規化します。
結合音 1100–1300 — 結合音帯を基準に正規化します。

並べ替えとカード／リストの切り替えは表示方法を変えるだけで、選択内容は変わりません。

続行すると次の処理が行われます。選択した各測定に、選んだ範囲で SNV を適用し、続いて各波長をファイル内のすべての測定にわたって (値 − 平均) / SD として標準化し、最後に群ごとに繰り返しを平均します。これらは自動で行われ、ほかに設定はありません。

左側の Aquagram® 用の入力には、選択した群ごとに 1 行が表示されます（見出しは *元の群 · SNV 適用済み*）。各行には、その線に使われる色の点が付いています。

そのまま進むこともできます。プロットしたい行にチェックを入れて、ステップ 4 へ進んでください。あるいは右側の操作パネルで、先に行を組み合わせられます。

平均行を作成（または合計・減算）を選択すると、結果が左側の*処理済みの結果*に表示されます。鉛筆アイコンで名前を変更、× で削除でき、別の操作の入力としても使えます。

必要な行にチェックを入れたら、Classic-12 Aquagram® を作成を選択します。

チェックした行が、それぞれ 1 本の色付きの線になり、チャートの下の凡例に並びます。

凡例の項目を選ぶと、その線を非表示または再表示できます。
チャート上部の − / + で拡大・縮小します。100% を超えるとドラッグで移動できます。
線にカーソルを合わせると、WAMACS のラベル、波長、値が表示されます。
全体平均の結果表を表示すると、固定の 12 行の表（プロットした行の平均）が開きます。
XLSX / CSV / PNG / JPG を出力します。XLSX と CSV にはプロットした線ごとに 1 列が含まれ、別の場所でチャートを再現できます。PNG と JPG はチャートと凡例をまとめて保存します。

やり直すときは、左側で前のステップを選ぶか、別のファイルを開いてください。